FUT2 基因编码岩藻糖转移酶 2 与幽门螺杆菌附着在胃黏膜相关，进而抑制维生素 B12 的吸收。FUT2 的变异会影响血清中维生素 B12的水平。该基因上位点 rs1047781 携带 TT 基因型的人，胃黏膜的幽门螺杆减少，血清中的维生素 B12 浓度更高。

FUT6 基因编码岩藻糖转移酶 6，参与形成 Lewis 抗原。这些抗原把胃病原体（如，幽门螺旋杆菌）附着在胃黏膜上，从而降低维生素 B12 在胃中的吸收。该基因上位点 rs3760776 携带 AA 基因型的人，胃黏膜幽门螺旋杆菌少，血清中的维生素 B12 浓度更高。

MS4A3 基因编码跨膜 4A 基因家族的成员。这种蛋白主要参与造血细胞周期调节。该基因可能在胃肠道的细胞周期调控中发挥作用，从而影响肠上皮细胞和胃上皮细胞的更新和维生素 B12 的吸收。该基因上位点 rs2298585 携带 TT 基因型的人，肠上皮和胃上皮细胞更新速度将快，维生素 B12 吸收变好，血清中的维生素 B12 浓度更高。

CLYBL 基因参与金属离子结合、碳-碳裂解以及柠檬酸（pro-3s) 裂解酶活性功能中。该基因编码了柠檬酸裂合酶，参与线粒体B12 的通路中。该基因位点 rs41281112 变异（携带 T 基因型）干扰了 CLYBL 蛋白与金属离子的集合，导致维生素 B12 浓度降低。