“父系单倍型类型”更新问题集中反馈贴

各位23魔方的用户以及祖源爱好者大家好,感谢大家一直以来对23魔方祖源工作的持续关注:

23魔方祖源研究、生信、产品及开发团队,经过近半年的紧张工作安排,把之前使用“ISOGG-Y染色体分化树”来生产芯片产品的“父系单倍群”,改成使用自建的Y染色体分化树来生产“父系单倍群”结果。昨晚已经把所有芯片用户的父系单倍群结果按照新树形、新算法重跑了一遍。

事前虽然经过了5轮的修正和核对,尽最大的努力避免算法或位点质量带来的分型错误,但由于芯片用户基数大、设计位点数量多、分化树分支庞杂等原因,难免会有错误的产生。如果用户有发现家庭中的父子或兄弟,芯片单倍群的分析结果不一致(如果父子兄弟类型属于上下游关系,可能是由于芯片版次的问题带来设计位点的差异造成的),尤其是被分到属于平行关系的2个支系中去的;或者是芯片分析的结果与本人“父系祖源深度检测(Y全序)“分析的结果不属于上下游关系,而属于平行关系的,都可以在此贴反馈,以便我们进一步核对修正。

另外需要澄清的几个问题:

1.芯片用户被分到终端类型中,这个终端类型的年龄被表示为共祖60年的,表示芯片位点匹配到这个类型下一个全序用户的私有位点里,实际共祖时间应该在60年到上一个节点共祖时间之间.

 比如,O-Y138481类型,是一个终端类型,他是一个全序用户的私有位点组成的节点,树上显示该节点的共祖时间是60年(所有“父系祖源深度检测(Y全序)“用户的终端都显示共祖60年),他的上游节点是O-MF1074,共祖时间是2370年。由于该用户的私有位点在芯片位点中有覆盖,现在有105个用户被分到了O-Y138481类型,并不表示这里面的106人之间共祖在60年,而是共祖在60年~2370年之间。如果这里面的105个用户,有人做了“父系祖源深度检测(Y全序)“,就会把之前放在私有位点节点里的共享点独立出来,成为一个新的节点。

2.现在分化树上节点的共祖时间,严格意义来讲是“父系祖源深度检测(Y全序)“用户之间的共祖时间。中间节点所匹配到的芯片用户,他们之间的共祖时间严格意义来讲也是在本节点共祖时间和而上一节点共祖时间之间这个范围的。如果这2个节点时间跨度越大,共祖时间的可能性就越多;反之则会比较紧缩于一段时间之内。如果想要严格得出共祖时间,还需要做“父系祖源深度检测(Y全序)“。

3.芯片位点覆盖到某个人的私有位点中,第一种可能是在前2版的芯片设计时候专门设计进去的点(比如ISOGG树上的点、早期全序用户的私有位点、千人组、HGDP\SGDP等公开数据库的点)。 另外一种可能是没有特意去设计,而是之前设计的这些点,正好也是某个新的全序用户的私有位点。即之前设计的某个位点是个平行突变位点,在新的支系中也有这个突变位点。我们发现这类平行突变的位点还是比较多的。甚至见到过一个极端的案例,之前千人组R类型样本下发现的一个位点,在全序树上15个支系都发生了平行突变,而且这个点经评估还是优质好用的点。这种点我们也会对芯片用户进行细分。所以,这种之前设计的点发生平行突变,也是后面做父系深度检测用户可能想不到的惊喜点。

说类型分错的用户希望提供以下类似的证据以便于我们核查修复:具体话术最好如下:


1.我的父系祖源深度检测结果是O-MFxxx,但是芯片结果是O-MFxxx,我们在树上属于平行的关系。

2.我的芯片检测结果是O-MFxxx,但是我父亲(或儿子、兄弟(不包含家谱上的家族同宗)的芯片结果是O-MFxxx。我们在树上属于平行的关系。

凭借之前的分类结果(可能之前是假阳性分错的)给你的印象,认为分错的,这个我们真的无从下手去核对。
191 条评论

加齐

我表弟原先测的T-M184虽然是错误的  但是可以看见同宗  更新后是T   共祖3W年  直接没办法看见同宗了,这弊端很大  ,希望修改
  • Mr.傑 PRO

    05-20
    因用户隐私,基因寻宗默认只展示16500年内的宗亲。考虑到部分支系的共祖时间较为久远,我们会开放“展示同支系”的宗亲,此需求已经在排期中,具体上线时间需要看现有的其他工作的完成进度。
  • 加齐

    05-20
    @Mr.傑:好的👌🏻 谢谢

流年似水

之前在其它平测过y全序,为什么魔方树有更我下几层2800年的支系,但是昨天更新只把我放到6500年的支系,而且有好多人也是这样的情况,这是为啥子?
  • 庸人自扰♥

    05-20
    Y全序和芯片是没有关系的,更新只是芯片树,用的是你的中通芯片数据,而不是依据你的Y全序数据
  • 流年似水

    05-20
    @庸人自扰♥:谢谢解答,在问下我下游有一支3400年支系,我在yfull是在该支的,本次更新有一百多人分到该支,而我在他们上游好几层?

大壮

 我上游那三个人分到别的支了,我下沉到已检测未匹配的点位。是不是没更新完?感觉更不靠谱了,分布图都散了没有集中渐变。

陈剑

我是3039下6634中的y158000,我其实有两个账户,一个就是y158000,但另一个还停留在3039上,我和我自己共祖1700多年,很搞笑哦,望解决

  • 远寒斋主 PRO

    05-20
    芯片版本的问题(芯片位点设计数量的差异)带来的,可以通过客服申请账号合并,也就2个账号合并成1个。
  • 父系祖源

    05-23
    @远寒斋主:刘老师,您好,每次23魔方更新app造成用户的基因寻宗功能被自动关闭,造成联系不上已经新高通的父系同宗,下次更新app能否解决这个问题,每次更新app后不自动关闭基因寻宗功能,谢谢。
志远

陈志远

有关数据方面还是需要谨慎发布,弄得用户不知所措,改来改去不是很慎重。如果检测数据的确是到了某个程度,可以给用户编排,这次混乱导致涉及的人员太多,不够严谨,用户对魔方的认可度也会降低。

远寒斋主 PRO

  • 父系祖源

    05-23
    刘老师,您好,为什么23魔方不愿意搞一个官方QQ,微信群啊?