23魔方为何检测不出满族血统?

“为何我是满族人却没有测出满族血统?”

这是一个高频的问题,答案是我们可检测的民族中并不包含满族。


23魔方可检测民族血统:
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那么大个民族居然测不出来?

其实这是市面上所有基因检测都在头疼的问题,但为了解决这个问题我们曾多次征集满人样本,希望有所突破。可是按照目前的算法我们还是没能测出来满族。



那么我们是根据什么检测民族血统的呢?

想知道个体的基因祖源,就需要把基因组与一个已知明确种群分类的样品集合做比对通过其相似度来进行推断,得出检测者基因组民族祖源成分。
有很多方法可以估算基因组的种族民族成分但都要依赖一个成型参考集合数据库。它的质量对祖源民族成分准确度起到了关键作用所以我们在集合数据库的时候十分谨慎。

23魔方祖源民族数据库一共会经历四个步骤:

参考样品选取

亲缘关系过滤

PCA过滤 

panel参考集性能测试
 

参考样品选取
以每个民族始祖的DNA定义民族样本是再合适不过,然而现实让人无奈不是每个民族都有古DNA样本的,加上近百年来迁徙频率加快,让我们去进行民族样本的划分更是难上加难。为了确保参考集的客观,我们选取参考集的标准是:
三代同宗
(即从自己往上推三代祖先中都必须同一个民族,同一个省份)最大限度地保证参考集的特异性。


亲缘关系过滤
有亲缘关系的样品因为在基因组上格外相似会引起频率计算的偏向,如果一个参考祖源中的亲缘关系样品比较多,在某些SNP上的频率就会额外偏高。所以对于参考集合第一步质控就是过滤有亲缘关系的样品。


PCA过滤
PCA(主成分分析)是在群体遗传学上一个常用的基因组聚类方式23魔方的芯片有70万个位点,相当于从70万个维度定义一个样本PCA就是把70万维降维到2维平面(如下图)
散点图2-ch_画板 1 副本.png

一般情况下同一个地区的人群样本往往会如图中一样聚集在一起,通过这种方式可以快速排除离群的样本,使得参考集更纯。


Panel参考集合性能测试
过滤后的还需要对参考集合做进一步的训练测试,通过Leave-One-Out(留一法)来对参考集合进一步筛查,对异常或者“不纯”的参考样品删减,从而使我们祖源参考集合性能达到最优。


我们统计了23魔方数据库里的资料,把用户填写满族的民族血统分布作成民族成分分布的箱线图
 ManComposition(1)-01.png

可以看出绝大部分的满族成员,主要成分分布在北方汉族范围,没有存在特别的的民族血统分布。
 
我们还专门征集了20个样本(拥有家谱记载的三代同宗的满族人)

姓氏表(1).png

并结合公开的民族数据库进行PCA分析,分析如下图。散点图1-ch_画板 1 副本.png
红色点为我们征集的满族样品,可以看出几乎全部都落在北方汉的集群位置中。
结合我们23魔方已有的数据库以及征集的有家谱记载的满族样品并结合算法模型对满族进行预测。在已有的数据和模型下根据现有技术我们无法构建一个满族训练集合。
本着对用户负责的态度,为了追求结果的严谨和准确度所以我们暂时不支持满族的民族血统预测。

目前有很多民族血统跟满族一样,我们无法构建出参考集,但在探索的过程中我们也找到了更多样的血统参考集。新版民族血统正在测试中,如果您有独特的血统或者好的建议可在社区留言,欢迎您加入一起探索。
65 条评论

财菜

所以新版有哪些民族?
  • 叶子哥

    2018-01-17
    暂时期待一下吧,相应的祖源结果也会有一定的变化
  • 心光

    靛蓝心光

    2018-01-17
    @叶子哥:什么时候出?

叶子哥

Nice~继续努力
  • 完颜洪烈s

    2018-01-17
    请问蒙古族测出来很少是什么原因呢?
  • 叶子哥

    2018-01-17
    @完颜洪烈s:蒙古族这块新版也会有大的更新,我们之前使用的是外蒙的参考集合,跟我们大部分国内蒙古还是有比较大的差别;到时候还是看新的参考集合结果吧:),谢谢
SC

scyagjc

作为父系蒙古族的我,查不出一点蒙古族基因

  • 默认头像

    3465

    2018-04-16
    那就给你阿布,欧布做检测。一直往上查!!!
  • 方夫

    袁陈方夫

    2018-07-25
    有几种可能哦,你祖上是汉人投降了蒙古或者是俘虏/奴隶被抓走,赤峰蒙古族中50%是汉人后代。还有种可能就是蒙古常年和汉人通婚,常染色体和汉人没区别了。当然确认祖先最简单的方式就是看父系基因。
雪珂

颜雪珂

一句话 就是做不到呗 我可以理解为满族和汉族的基因差异很小么…

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    3465

    2018-04-16
    就是这样。其实满族和北方汉族早就融为一体了。整个北方汉族,就是满族。没毛病。
  • 方夫

    袁陈方夫

    2018-07-25
    @3465:瞎扯。满族从起家就混杂了东北各族,他本是就没有主体血缘,再加上汉人数量大导致旗人通婚的后代和汉人没区别。我个人理解主要不是东胡系父系祖源的满族都很难检测出满族成分。

Y177728

北汉标杆太粗,早该修改了。
梦圆

余梦圆

如果23后面能测出满族和蒙古族的基因,以前测过的还可以重新测么?测的时候不知道不可以,可是奶奶辈可能有蒙古族血统

  • 财菜

    2018-01-21
    应该是不用的,只是改算法而已
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    3465

    2018-04-16
    重新测要不要重新收费呢?
建纲

第五建纲

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    3465

    2018-04-16
    文化?满族连满语都快没了,还谈什么文化。
  • 建纲

    第五建纲

    2018-04-16
    @3465:语言只是文化的载体之一,也可以是别的东西,比如服饰、生活习惯、建筑、民族心理等,满语也没有完全消失,只不过会说的人少了而已,这跟满族入关后迅速汉化有关。