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我和同宗几百年的宗亲的bam文件，数据量为什么相差这么大？馆长请进！

2020-09-10· 2594 浏览18 评论

春天看花冬天看雪

亲爱的馆长，我帮我爸高通之后，发现了一个共祖五百年内的同宗，我是今年高通的，他是2019年高通的，我们比对发现，他的bam文件只有200多M，而我的有600多M，数据量为什么相差这么大呢？是因为什么原因呢？求馆长科普，谢谢！
18 条评论
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家谱馆长

2020-09-10
这都是正常情况，深度绝对有保证，请放心使用

4 评论

2 赞

  • 梓源堡

    2020-09-10
    馆长，科普下文件大小不同造成的原因吧！了解越多，误会越少嘛！

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  • 家谱馆长

    2020-09-10
    @梓源堡：Y检测的bam主要是看有效的覆盖率，至于文件大小，和测序环节有关系，大的不一定更好，小的也不一定更差

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梓源堡

2020-11-23

1 评论

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  • 梓源堡

    2020-11-23
    @PRO：一个读取次数多，覆盖反而少一点，所以平均检测深度48X；另一个样本读取次数只有三分之一多点，覆盖却大一点，平均深度自然低很多，只有15X，三分之一不到。我推测是检测深度有差异。还被忽悠了

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梓源堡

2020-09-10

一定是检测的深度不够，被魔方糊弄了。😄

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  • 春天看花冬天看雪

    2020-09-10
    小心被馆长关你小黑屋(◍′˘‵◍)

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[已注销]

2020-09-10

一个源基因，一个23魔方，

8 评论

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  • 春天看花冬天看雪

    2020-09-10
    不是，我们两个都在23魔方高通的，差别只是时间，他2019年，我2020年。

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  • [已注销]

    2020-09-10
    @春天看花冬天看雪：可能他源基因高通的，传的bam上魔方

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